Gibt es hier FFmpeg -Nutzer?

Praktisch jeder Linux-Nutzer nutzt auch ffmpeg, nur wissen das die meisten gar nicht. Es ist ein Standardprogramm, zur Installation muss man auch keine Anleitung bemühen, sondern das wird ganz banal von der Paketverwaltung der jeweiligen Distribution erledigt. Falls deine Seite in irgendeiner Form auf einer Linux Maschine gehostet wird, ist daher die einfachste Lösung, erstmal zu schauen obs nicht eh schon installiert ist und ansonsten den Serveradministrator zu bitten, das Paket halt noch zu installieren. Wenn du einen Shared Webhost hast der aus welchen Gründen auch immer solche Extrawürste nicht macht, dann hast du halt Pech gehabt - bei speziellen Softwareanforderungen ist es immer besser, wenn du selbst der Herr im Hause bist, also entweder eigenen Root (V)Server hast oder einen Hoster der auf deine Anforderungen eingeht.

Falls du erwägst, ffmpeg ohne Hilfe seitens des Hosters lokal in deinem Home-Verzeichnis (bzw. in deinem Webverzeichnis) zu installieren, davon kann ich eher nur abraten. Es ist theoretisch möglich, praktisch ist es die Hölle sowas durchzuführen, da du Kenntniss über das System benötigst, die du nicht oder nur bedingt hast, etwa: Welche Libraries sind auf dem System schon installiert, wie erfüllst du die Dependencies auf dem Server, darfst du überhaupt eigene Executables auf dem Server ablegen (abgesehen von CGI-Scripten, ffmpeg ist aber kein solches), etc. Auch erzeugt ffmpeg wenn es Videodateien umcodieren soll einen beträchtlichen Systemload, den ein shared webhosting System so ohne weiteres nicht vertragen muss.