Drupal Site mit Integration von anderen Diensten

Hallo!

Wie integriere ich vorhandene Dienste die z.B. auf jsp oder perl aufsetzen in eine neue Drupal 7 Site auf dem gleichen Server?

Grundlegend möchten wir eine normale Drupal Site bauen, aber bestimmte Bereiche (z.B. Shop) nutzen dann eine andere Technologie. Hier soll aber trotzdem die Drupal-Navigation, Footer, etc. sichtbar sein.
Für den User sollte keine Trennung sichtbar sein, sowohl bei den Pfaden (url aliases) als auch bei der Menünavigation.

Wie ist hier eine saubere Implementierung beider Systeme möglich bzw. welche Herangehensweise ist zu empfehlen?
Auf dem Server selbst laufen dann natürlich 2 Server z.B. Apache für Drupal und Tomcat für Java.

Vielen Dank.