Core Module deinstallieren - bestes Vorgehen?

Ich habe bei einer Installation von Drupal 8.4 via backend das Contact und das Search Modul deinstalliert, weil ich mit Search API und Webform arbeiten möchte.

Die Module werden ja nach neuer Logik komplett entfernt und tauchen dann auch nicht mehr in der Liste der Core-Module auf.

Nun sehe ich bei einer Varbase-Distribution-Installation, die ich zum Testen angelegt habe, dass dort die beiden Module einfach keinen Haken haben, aber noch in der Liste erscheinen.
Warum ist das dort anders? Wie haben die das gemacht?
Das Modul Disable modules ist nicht installiert, soll ja auch nicht mehr verwendet werden.

Wäre das Ergebnis ein anderes gewesen, wenn ich die Module via Drush oder Composer entfernt hätte?

Mir ist im Grunde egal, ob die Module in der Liste auftauchen, ist eine reine Verständnisfrage.