Anchor Links im Hauptmenü seit Update auf Drupal 7.57 ohne Funktion

Es hängt vermutlich an JavaScript, da die Ankor-Tags im HTML nicht vorhanden sind. Wenn Du in der Lage bist, die a-Tags in der Form <a name="SECTIONID"></a> einzubauen, solle es aber auch ohne JavaScript gehen.

Ja, es könnte mit JavaScript zusammenhängen, aber es kommt kein JavaScript Fehler in der 'Chrome Console', der damit zusammenhängt.

Dass die Anchor fehlen ist grundsätzlich kein Problem, da dies ja in Drupal 7.56 und davor problemlos funktioniert hat und auch im Internet Explorer in 7.57 funktioniert.

Umbauen möchte ich eigentlich nicht, es muss irgendeinen Weg geben herauszufinden, wo das Problem liegt um es dann im Theme zu beheben.

Da es sich um ein Kauftheme handelt, hast Du da nicht viele Mitstreiter, fürchte ich.

JavaScript debuggen, wenn kein Fehler auftritt?

Das läßt sich nur sinnvoll debuggen, wenn man das JavaScript in einer nicht minimierten Version hat (es also klar lesbar ist). Bei Drupal 7.57 ist etwas in der Ausführung geändert worden, um Cross-Site-Scripting über JavaScript zu vermeiden (liegt hier der Grund?). Es gibt Tools, die ein Debuggen von JavaScript gerade im Chrome ermöglichen (Phpstorm). Eine einfache Methode ist erst mal an strategischen Stellen ein alert einzufügen um den Ablauf zu kontrollieren bzw. zu prüfen, ob das Script überhaupt ausgeführt wird. Dazu sollte JavaScript in Drupal beim Debuggen nicht komprimiert werden.

Das Problem lies sich lösen durch Umstellung der JQuery-Version von JQuery 1.7 auf 1.8.